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我就废话不多说了,大家还是直接看代码吧~
## using simpleITK to load and save data. import SimpleITK as sitk itk_img = sitk.ReadImage('./nifti.nii.gz') img = sitk.GetArrayFromImage(itk_img) print("img shape:",img.shape) ## save out = sitk.GetImageFromArray(img) # # out.SetSpacing(itk_img.GetSpacing()) # # out.SetOrigin(itk_img.GetOrigin()) sitk.WriteImage(out,'simpleitk_save.nii.gz')
读取DICOM序列
import sys import SimpleITK as sitk import numpy as np dcm_directory = "./flair_dicom" series_ids = sitk.ImageSeriesReader.GetGDCMSeriesIDs(dcm_directory) print("series ids:",series_ids) if not series_ids: print("ERROR: given directory dose not a DICOM series.") sys.exit(1) series_file_names = sitk.ImageSeriesReader.GetGDCMSeriesFileNames(dcm_directory,series_ids[0]) series_reader = sitk.ImageSeriesReader() series_reader.SetFileNames(series_file_names) image3D = series_reader.Execute() size = image3D.GetSize() print( "Image size:", size[0], size[1], size[2] ) image_array = sitk.GetArrayFromImage(image3D) # SimpleITK读取的图像数据的坐标顺序为zyx,即从多少张切片到单张切片的宽和高; # 而据SimpleITK Image获取的origin和spacing的坐标顺序则是xyz origin = image3D.GetOrigin() spacing = image3D.GetSpacing() print("origin:",origin," spacing:",spacing)
读取DICOM单个文件
import SimpleITK as sitk import numpy as np image = sitk.ReadImage(slice_path) image_array = sitk.GetArrayFromImage(image) # z, y, x
补充知识:itk 读取图像,两种格式之间转换
我就废话不多说了,大家还是直接看代码吧~
/******************************************************* 控制台运行程序 输入: 程序名称 读取图像文件名 保存图像文件名 输出: 保存另一种类型的图像 功能: 图像在jpeg和bmp两种格式之间互换 ********************************************************/ #include "itkImageFileReader.h" #include "itkImageFileWriter.h" #include "itkImageIOFactory.h" #include "itkBMPImageIOFactory.h" #include "itkJPEGImageIOFactory.h" #include <iostream> int main(int argc , char *argv[]) { if (argc < 3) { std::cerr << "Usage: " << std::endl; std::cerr << argv[0] << " inputImageFile outputImageFile " << std::endl; return EXIT_FAILURE; } itk::BMPImageIOFactory::RegisterOneFactory(); itk::JPEGImageIOFactory::RegisterOneFactory(); typedef itk::Image< unsigned char, 2 > ImageType; typedef itk::ImageFileReader< ImageType > ReaderType; typedef itk::ImageFileWriter< ImageType > WriterType; ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New(); WriterType::Pointer writer = WriterType::New(); const char * inputFilename = argv[1]; const char * outputFilename = argv[2]; reader->SetFileName( inputFilename ); writer->SetFileName( outputFilename ); writer->SetInput( reader->GetOutput() ); try { writer->Update(); } catch( itk::ExceptionObject & err ) { std::cerr << "ExceptionObject caught !" << std::endl; std::cerr << err << std::endl; return EXIT_FAILURE; } system("pause"); return 0; }
以上这篇使用SimpleITK读取和保存NIfTI/DICOM文件实例就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持。
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RTX 5090要首发 性能要翻倍!三星展示GDDR7显存
三星在GTC上展示了专为下一代游戏GPU设计的GDDR7内存。
首次推出的GDDR7内存模块密度为16GB,每个模块容量为2GB。其速度预设为32 Gbps(PAM3),但也可以降至28 Gbps,以提高产量和初始阶段的整体性能和成本效益。
据三星表示,GDDR7内存的能效将提高20%,同时工作电压仅为1.1V,低于标准的1.2V。通过采用更新的封装材料和优化的电路设计,使得在高速运行时的发热量降低,GDDR7的热阻比GDDR6降低了70%。
更新日志
2024年10月05日
2024年10月05日
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- 纪钧瀚《胎教古典音乐 钢琴与大提琴的沉浸时光》[FLAC/分轨][257.88MB]
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